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La Gastro-entérologie s'attache à diagnostiquer et traiter les pathologies de l'appareil digestif; les gastro-entérologues disposent de diverses techniques d'investigation : celles de l'imagerie médicale et celles regroupées sous le terme "endoscopie"; la gastroscopie, la sigmoïdoscopie, la colonoscopie, d'utilisation quotidienne, permettent de visualiser à l'intérieur des organes, d'y prélever des biopsies.

Les gastro-entérologues et les chirurgiens coopèrent très régulièrement, dans la mesure où plusieurs maladies de l'appareil digestif relèvent d'un traitement chirurgical.